PCR管/板有多种颜色，如透明色、白色、黄色、蓝色、红色……普通的PCR过程中，管/板的颜色并不会影响PCR的结果，但是在qPCR中，管/板的颜色对于结果是有很大的影响的。

应用于qPCR的耗材，一般是白色或者磨砂的塑料耗材。qPCR在DNA扩增反应中，以荧光化学物质测每次PCR循环后产物总量，因此与透明塑料管/板相比，白色或磨砂的管/板在应对荧光时表现更为灵敏，并且结果更加准确。这是因为白色的耗材可以阻止荧光折射出管，达到荧光折射的最小化，将更多的荧光信号反射回检测器，从而增加信噪比，表现为更高的灵敏度；另外，白色管壁也可阻止荧光信号被PCR仪的加热模块吸收或进一步反射，从而可以降低重复实验中的误差，提高准确性。除此之外，在进行qPCR时需使用超透明的管盖或光学密封膜来密封PCR管/板，保证荧光不受干扰；还需要参考qPCR的耗材要求，选择最合适的耗材，达到优的实验效果。