全外显子组测序服务

2023-12-10

产品介绍全外显子组测序(Whole Exome Sequencing,WES)是利用探针杂交富集蛋白编码区域DNA序列,通过高通量测序,发现与蛋白质功能变异相关的遗传突变。研究显示:人类全外显子组只占人类全基因组长度的1%左右,由DNA变异引起的疾病大致有80%以上来自于外显子组区域的变异,因此全外显子测序远比全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS)更简便、经济、,其目标区域覆盖度也更高,便于变异检测。

检测流程

1、样本采集,提取基因组DNA。

2、将基因组DNA打断,构建随机片段文库。

3、文库纯化,然后通过外显子捕获系统进行杂交富集。

4、PCR扩增,qPCR质量检测。

5、上机进行高通量测序。

6、数据分析。

信息分析流程

信息分析内容

1、去除接头污染和低质量数据。

2、进行数据产量统计分析、测序深度分析、覆盖度均一性分析。

3、SNP、Indel变异信息检测。

4、SNP、indel的RefGene注释。

5、SNP、Indel数据库分析 (与dbSNP、千人基因组数据、ESP外显子组数据库、炎黄基因组数据进行数据库注释分析) 。

6、单样品SNP保守性预测、致病性分析 (SIFT、Polyphen-2、Phylop、GERP scores)。

7、SNP、InDel在各基因功能元件上的分布统计。

样本要求

1、基因组DNA:Illumina:DNA浓度≥20 ng/μl,总量≥6 μg,OD 260/280介于1.8-2.0之间,电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整。样品浓度越高越好。

2、血液样品:请使用专业抗凝管储存样品。哺乳动物血液提供>2ml,有细胞核的血液>500ul。

3、样品中有多糖、糖蛋白的残留,往往对打断DNA样品带来非常大的麻烦,且很难去除,因此特别要求,客户提供的样品一定要将多糖或糖蛋白去除干净。

4、样品保存期间切忌反复冻融。

服务流程

1、提交项目课题相关需求和资料。

2、与我们的专业技术团队讨论项目细节。

3、根据讨论后的意见对实验方案进行修改。

4、双方均满意并达成一致,签订技术服务合同。

5、开展实验,按期完成合同规定的内容。

6、结题,提供实验原始结果和分析结果、实验流程、实验条件等等。

我们的优势

1、适用于单细胞、微量细胞样品。

2、数据质量高、偏差小、高度均一。

3、高通量,单个样本可达30-100X的测序深度和数据产出量。

4、*的覆盖度,能检测到90%以上的SNP位点信息。

5、检测灵敏度和准确度高。

6、能够全面发掘新的和稀有的遗传变异

咨询与订购

感谢您选择我们的服务,如果您有任何问题,请联系我们,我们将竭诚为您解答和服务。

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