离子交换层析是以生物分子的净表面电荷不同为原理来进行分离的 , 生物分子会根据其净表面电荷的大小、密度和分布形成不同的相互作用。

在 pH 值等于等电点（pI）时，生物分子没有净电荷，则不会与凝胶基质发生相互作用。基于工作 pH 值的不同，生物分子会与阴离子或阳离子交换介质表达出交互作用。因此，当 pH 值高于其等电点时，该生物分子会与正电荷介质（阴离子交换剂）相互作用；而当 pH 值低于其等电点时，该生物分子会表现出与负电荷介质（阳离子交换剂）亲和。

· 阴离子交换凝胶：

ABT 提供两种阴离子交换剂：Q Rapid Run™琼脂糖微球 ：使用季铵活化的高度交联微球。DEAE Rapid Run™琼脂糖微球：使用二乙氨基乙基活化的高度交联微球。

· 阳离子交换凝胶：

ABT 提供两种阳离子交换剂：SP Rapid Run™琼脂糖微球：使用磺丙基活化的高度交联微球。CM Rapid Run™琼脂糖微球：使羧甲基活化的高度交联微球。